Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms