Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms