Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms