Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF8

HSP90AB2P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB2PQ58FF8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSP90AB2PQ58FF8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms