Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms