Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms