Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF6Q330K2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms