Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms