Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPHKAPQ2M3C7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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