Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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