Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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