Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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