Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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