Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms