Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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