Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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