Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF2Q15853 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
USF2Q15853 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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