Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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