Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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NCAPHQ15003 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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NCAPHQ15003 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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NCAPHQ15003 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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NCAPHQ15003 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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NCAPHQ15003 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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NCAPHQ15003 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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NCAPHQ15003 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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NCAPHQ15003 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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