Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT33BQ14525 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT33BQ14525 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 335.3 ms