Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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BECN1Q14457 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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BECN1Q14457 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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BECN1Q14457 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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BECN1Q14457 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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