Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
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