Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms