Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms