Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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ITGA9Q13797 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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