Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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