Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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