Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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