Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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