Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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