Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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BNIP1Q12981 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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BNIP1Q12981 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BNIP1Q12981 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BNIP1Q12981 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BNIP1Q12981 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BNIP1Q12981 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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