Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXI1Q12951 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXI1Q12951 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXI1Q12951 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXI1Q12951 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXI1Q12951 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms