Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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