Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms