Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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KCNMA1Q12791 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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