Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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