Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms