Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms