Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LGALS3BPQ08380 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms