Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms