Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms