Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms