Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms