Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms