Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAP2Q03519 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms