Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms