Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NHLH2Q02577 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms