Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APBA1Q02410 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms