Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms