Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms